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16s/18s
16srDNA测序
16s/18s 2021-03-24 11:00

16SrDNA测序

16SrDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,具有10个保守区域和9个高变区域,其中保守区在细菌中差异不大,高变区具有属和种的特异性,对16SrDNA某个高变区进行测序,用于研究环境微生物中细菌或古菌的群落多样性。

细菌或原核生物16S rRNA
  细菌核糖体RNA(rRNA)有三种类型:5S rRNA(120bp)、16S rRNA(约1540bp)和23S rRNA(约2900bp)。5S rRNA基因序列较短,包含的遗传信息较少,不适于细菌种类的分析鉴定;23S rRNA基因的序列太长,且其碱基的突变率较高,不适于鉴定亲缘关系较远的细菌种类;16S rRNA普遍存在于原核细胞中,且含量较高、拷贝数较多(占细菌RNA总量的80%以上),便于获取模板,功能同源性高,遗传信息量适中,适于作为细菌多样性分析的标准。
  16S rRNA编码基因序列共有9个保守区和9个高可变区。其中,V4-V5区其特异性好,数据库信息全,是细菌多样性分析注释的最佳选择。